125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5036 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  100 
 
 
296 aa  587  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  100 
 
 
296 aa  587  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  98.65 
 
 
310 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  95.61 
 
 
296 aa  567  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  95.61 
 
 
296 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  91 
 
 
290 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  88.93 
 
 
296 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  51.04 
 
 
295 aa  262  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  46.85 
 
 
287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  45.07 
 
 
275 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  40.14 
 
 
276 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  42.27 
 
 
280 aa  195  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  37.76 
 
 
276 aa  192  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  34.74 
 
 
278 aa  192  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  37.68 
 
 
276 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  40.07 
 
 
279 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  35.66 
 
 
274 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  37.41 
 
 
274 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  42.36 
 
 
277 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  40.48 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  39.18 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  38.06 
 
 
276 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  37.7 
 
 
270 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  36.93 
 
 
276 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  38.54 
 
 
290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  37.37 
 
 
283 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  36.01 
 
 
276 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  36.14 
 
 
278 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  35.92 
 
 
275 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  41.9 
 
 
274 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  36.27 
 
 
291 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  38.19 
 
 
291 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  38.49 
 
 
279 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  38.49 
 
 
279 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  38.1 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  38.1 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  38.1 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  34.14 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  37.7 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  37.89 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  34.14 
 
 
290 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  36.27 
 
 
348 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  37.6 
 
 
286 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  40.74 
 
 
261 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  35.49 
 
 
275 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  37.37 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  35.91 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  32.88 
 
 
290 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  32.01 
 
 
288 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  33.89 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  33.11 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  29.93 
 
 
290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  31.74 
 
 
278 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
307 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  29.11 
 
 
292 aa  99.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  31.37 
 
 
322 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  32.13 
 
 
318 aa  95.9  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  30.87 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  29.15 
 
 
307 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  30.74 
 
 
319 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  30.74 
 
 
319 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  26.26 
 
 
291 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  27.1 
 
 
335 aa  89  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  31.19 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  28.3 
 
 
318 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  30.1 
 
 
320 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  29.97 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  23.02 
 
 
294 aa  86.3  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  28.18 
 
 
278 aa  85.9  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  23.92 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  29.28 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  29.18 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  27.36 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  26.64 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  30.96 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  25.89 
 
 
319 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  27.2 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  27.19 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  29.9 
 
 
260 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  27.86 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  26.93 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  26.91 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  26.93 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  25.24 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  26.93 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  27.83 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  28.19 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  28.21 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  27.65 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  28.66 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  26.06 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63908  L-rhamnono-gamma-lactonase  26.14 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.689755 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  31.78 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  25.61 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  31.94 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  31.25 
 
 
348 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>