119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4807 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  97.84 
 
 
371 aa  722    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  87.94 
 
 
374 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  97.84 
 
 
371 aa  722    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  100 
 
 
371 aa  764    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  86.63 
 
 
374 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  62.43 
 
 
347 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  50.46 
 
 
335 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  44.71 
 
 
348 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  49.54 
 
 
339 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  45.21 
 
 
348 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  44.91 
 
 
348 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  44.91 
 
 
348 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  44.01 
 
 
348 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  46.08 
 
 
337 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  45.32 
 
 
348 aa  273  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  45.05 
 
 
335 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  36.39 
 
 
349 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  34.12 
 
 
297 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  32.84 
 
 
307 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  33.67 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  31.5 
 
 
318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  31.32 
 
 
290 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  32.3 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  28.11 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  29.22 
 
 
297 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  30.24 
 
 
292 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  30.45 
 
 
313 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  30.95 
 
 
319 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  29.85 
 
 
319 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  30.38 
 
 
378 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  30.63 
 
 
298 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  28.99 
 
 
302 aa  99.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  32.84 
 
 
298 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  32.35 
 
 
298 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  32.35 
 
 
298 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  30.13 
 
 
261 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  27.6 
 
 
303 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  27.41 
 
 
279 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  26.4 
 
 
288 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  27.16 
 
 
285 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  26.98 
 
 
314 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  27.93 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  27.52 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  28.91 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  27.84 
 
 
322 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  25.17 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  26.56 
 
 
296 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  28.7 
 
 
295 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  27.24 
 
 
296 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  27.12 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  24.77 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  27.38 
 
 
296 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  24.77 
 
 
276 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  23.62 
 
 
276 aa  77  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  25.7 
 
 
278 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
275 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  25.45 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  26.03 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  26.93 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  26.93 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  26.87 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  26.35 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  26.35 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  25.7 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  25.39 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  25.67 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  28.84 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  26.74 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  25.97 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  27.55 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  24.07 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  23.26 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  26.96 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  24.38 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  25.94 
 
 
276 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  26.8 
 
 
277 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  25.25 
 
 
307 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  27 
 
 
290 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  27.96 
 
 
291 aa  60.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
276 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  25.87 
 
 
270 aa  60.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  24.62 
 
 
290 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  24.62 
 
 
290 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  24.3 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  23.15 
 
 
283 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  25.67 
 
 
278 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  27.95 
 
 
295 aa  56.2  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  22.43 
 
 
291 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  23.64 
 
 
291 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  23.32 
 
 
282 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  25.34 
 
 
278 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01740  amidohydrolase 2  22.05 
 
 
291 aa  53.9  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  29.35 
 
 
279 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  29.35 
 
 
279 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  29.35 
 
 
279 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  25 
 
 
290 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  29.35 
 
 
279 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>