108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5393 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  100 
 
 		 348 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  100 
 
 		 348 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  90.8 
 
 		 348 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  98.28 
 
 		 348 aa  701    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  83 
 
 		 348 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  52.11 
 
 		 335 aa  350  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  50.88 
 
 		 347 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  44.41 
 
 		 371 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  44.41 
 
 		 371 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  44.91 
 
 		 371 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  45 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  48.15 
 
 		 337 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  44.84 
 
 		 374 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  44.98 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  44.74 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  37.39 
 
 		 349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  37.98 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  30.56 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  30.45 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  31.44 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  30.89 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  28.91 
 
 		 318 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  32.31 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  29.97 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  30.79 
 
 		 297 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  29.85 
 
 		 319 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  27.57 
 
 		 298 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  28.06 
 
 		 319 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  26.84 
 
 		 303 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  28.4 
 
 		 313 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  34.18 
 
 		 345 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  32.61 
 
 		 378 aa  93.2  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  26.54 
 
 		 290 aa  89.7  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 288 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  28.13 
 
 		 285 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  27.36 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  26.18 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  25.67 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  28.66 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  22.37 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  25.95 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  26.1 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  29.29 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  24.27 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  24.46 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  26.47 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  27.25 
 
 		 288 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  29.15 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  23.17 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  26.13 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  24.84 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  31.38 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  24.93 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  30.54 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  30.54 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  30.54 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  28.26 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  25.27 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  24.09 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  24.09 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  27.22 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  25.07 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  25.39 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  26.65 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  30.24 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  23.24 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  29.14 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  22.55 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  22.98 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  29.58 
 
 		 275 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  22.98 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  25.54 
 
 		 276 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  24.84 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  21.67 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  23.01 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  28.21 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  29.31 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 282 aa  53.5  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  25.91 
 
 		 270 aa  53.5  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  30.71 
 
 		 291 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  30.71 
 
 		 291 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  22.56 
 
 		 276 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  26.9 
 
 		 275 aa  52.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  28.57 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01740  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  23.44 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  30.71 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  25.97 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  21.54 
 
 		 276 aa  50.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  27.66 
 
 		 278 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  26.35 
 
 		 291 aa  49.7  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  25.99 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>