115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1831 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  100 
 
 		 299 aa  618  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01740  amidohydrolase 2  41.16 
 
 		 291 aa  231  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1174  hypothetical protein  39.13 
 
 		 318 aa  212  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.021087  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  29.62 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  27.71 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  31.82 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  30.07 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  29.72 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  27.07 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  27.42 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  27.7 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  25.7 
 
 		 313 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 322 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  25.96 
 
 		 319 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  25.45 
 
 		 290 aa  85.9  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 292 aa  85.9  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  24.52 
 
 		 307 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  25.18 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  28.17 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  26.11 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  28.31 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  25.91 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  24.37 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  25.91 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  25.91 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  25.91 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  25.91 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  25.91 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  28.04 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  26.49 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  25.72 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  25 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  25.08 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  24.72 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  24.28 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  26.26 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  27.2 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  26.47 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  25.61 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  24.07 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  24.54 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  22.97 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  27.55 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  27.55 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  27.55 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  24.39 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  28.68 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  26.02 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  27.66 
 
 		 374 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  27.04 
 
 		 374 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  26.28 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  26.47 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  25.54 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  24.32 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  27.06 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  24.52 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  24.5 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  25.49 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  26.24 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  25.5 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  21.55 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  25.39 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  25.39 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  24.44 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  22.22 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  25 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  25.76 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  25.76 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  23.28 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  23.73 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  25.76 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  24.78 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  23.7 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  25.54 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  27.61 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  23.44 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  23.91 
 
 		 387 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  19 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 335 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>