123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8310 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  100 
 
 		 347 aa  712    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  62.72 
 
 		 371 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  62.72 
 
 		 371 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  62.43 
 
 		 371 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  62.2 
 
 		 374 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  60.71 
 
 		 374 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  53.31 
 
 		 335 aa  357  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  51.47 
 
 		 348 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  51.47 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  50.59 
 
 		 348 aa  346  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  50.88 
 
 		 348 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  50.88 
 
 		 348 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  53.67 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  56.06 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  51.68 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  46.85 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  40.3 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  35.71 
 
 		 297 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  35.94 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  32.73 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  32.84 
 
 		 307 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  31.33 
 
 		 297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  30.42 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  31.55 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  32.22 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  29.82 
 
 		 297 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  31.91 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  30.51 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  33.56 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  31.25 
 
 		 319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  29.64 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  32.05 
 
 		 313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  30.59 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  28.74 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  28.74 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  31.1 
 
 		 292 aa  109  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  33.04 
 
 		 302 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  34.04 
 
 		 261 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  30.28 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  31.37 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  28.48 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  29.75 
 
 		 277 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  31.27 
 
 		 322 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  30.45 
 
 		 295 aa  92.4  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  27.58 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 276 aa  86.3  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  26.81 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  28.62 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  26.77 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  29.33 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  28.91 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  28.91 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  27.48 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  29.5 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  28.44 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  23.99 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  23.48 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  24.7 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  26.38 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  28.15 
 
 		 313 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  21.47 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  29.57 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  30.75 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  25.55 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  28.66 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  28.05 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  28.66 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  22.39 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  29.15 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  28.35 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  27.47 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  25.53 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  24.15 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  26.58 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  27.05 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  23.88 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  28.05 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  27 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  26.28 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  23.85 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  24.15 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  26.9 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  30.63 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  23.85 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  22.67 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  22.91 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  27.05 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  25.46 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  29.1 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  31.38 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01740  amidohydrolase 2  21.89 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>