122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6380 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  100 
 
 
318 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  39.13 
 
 
297 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  39.46 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  38.28 
 
 
319 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  39.02 
 
 
319 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  39.07 
 
 
299 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  37.34 
 
 
318 aa  202  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  39.33 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  37.95 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  38.67 
 
 
297 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  36.67 
 
 
297 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  38.21 
 
 
298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  38.21 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  38.21 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  37.54 
 
 
298 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  34.9 
 
 
314 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  35.33 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  35.45 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  35.37 
 
 
322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  35.55 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  35.88 
 
 
313 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  33.97 
 
 
320 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  32.11 
 
 
290 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  33.88 
 
 
319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  33.88 
 
 
319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  31.39 
 
 
302 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  29.1 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  32.33 
 
 
288 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  31.79 
 
 
279 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  31.41 
 
 
348 aa  123  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  30.9 
 
 
285 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  29.7 
 
 
285 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  31.6 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  30.3 
 
 
349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  29.79 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  28.43 
 
 
291 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  29.63 
 
 
276 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  28.05 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  29.91 
 
 
339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  28.11 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  29.09 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  30.59 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  28.11 
 
 
371 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  28.11 
 
 
371 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  31.8 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  32.48 
 
 
261 aa  109  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  30.3 
 
 
276 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  28.91 
 
 
348 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  28.91 
 
 
348 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  29.18 
 
 
282 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  31.84 
 
 
279 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  31.84 
 
 
279 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  31.84 
 
 
279 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  31.84 
 
 
279 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  29.43 
 
 
278 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  31.84 
 
 
279 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  27.61 
 
 
276 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  31.84 
 
 
279 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  29.33 
 
 
278 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  27.71 
 
 
304 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  27.73 
 
 
348 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  30.33 
 
 
348 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  29.57 
 
 
273 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  29.51 
 
 
278 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  26.9 
 
 
274 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  29.29 
 
 
276 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  28.25 
 
 
307 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  28.24 
 
 
288 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  28.11 
 
 
335 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
374 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  27.48 
 
 
278 aa  99.4  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  27.94 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  27 
 
 
374 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  30.67 
 
 
274 aa  96.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  27.09 
 
 
287 aa  95.9  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  26.51 
 
 
276 aa  94  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  26.43 
 
 
270 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  28.62 
 
 
291 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  23.49 
 
 
274 aa  93.2  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  28.48 
 
 
278 aa  93.2  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  27.03 
 
 
337 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  30.45 
 
 
277 aa  92.4  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  27.87 
 
 
275 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  28.98 
 
 
378 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  27.6 
 
 
283 aa  89  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  28.52 
 
 
296 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  30.09 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  27.09 
 
 
345 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  23.92 
 
 
276 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  28.03 
 
 
286 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  22.15 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  28.3 
 
 
296 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  28.3 
 
 
296 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  26.64 
 
 
299 aa  87  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  24.28 
 
 
294 aa  87  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  28.85 
 
 
296 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  28.04 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1174  hypothetical protein  26.06 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.021087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>