123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3135 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  100 
 
 		 295 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  51.74 
 
 		 310 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  50.34 
 
 		 296 aa  279  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  51.04 
 
 		 296 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  50.69 
 
 		 296 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  51.04 
 
 		 296 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  50.35 
 
 		 296 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  49.65 
 
 		 290 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  45.49 
 
 		 287 aa  238  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  40.28 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  39.93 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  35.86 
 
 		 276 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  37.8 
 
 		 276 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  36.81 
 
 		 274 aa  185  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  39.68 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  36.11 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  33.57 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  36.21 
 
 		 276 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  39.18 
 
 		 277 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  36.46 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  37.15 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  37.41 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  37.41 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  37.41 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  37.41 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  37.41 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  37.06 
 
 		 279 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  37.15 
 
 		 278 aa  159  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  37.68 
 
 		 348 aa  158  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  35.71 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  36.93 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  35.4 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  35.31 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  35.96 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  35.35 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  34.38 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  36.36 
 
 		 278 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  37.98 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  34.75 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  36.51 
 
 		 291 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  36.51 
 
 		 291 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  36.51 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  32.89 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  33.56 
 
 		 275 aa  125  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  36.77 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  30.41 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  34.78 
 
 		 273 aa  122  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  29.73 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  35.15 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  30.41 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  36.3 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  31.63 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  31.77 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  30.98 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  27.65 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  31.87 
 
 		 260 aa  95.9  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  28.17 
 
 		 281 aa  89.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  28.44 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  28.44 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  28.44 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  23.2 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  26.77 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  29.64 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  25.76 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  27.38 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  26.13 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  26.23 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  24.18 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  26.88 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  27.8 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  27.92 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  26.28 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  25.42 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  24.84 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  25.88 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  26.64 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  27.33 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  25.48 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  27.56 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  27.56 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  24.01 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  27.95 
 
 		 371 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  26.43 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  26.28 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  27.95 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  27.95 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  26.28 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  23.97 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>