125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1291 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  100 
 
 		 288 aa  596  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  56.54 
 
 		 285 aa  341  7e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 300 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  26.33 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  25.7 
 
 		 276 aa  89.4  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.8 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  27.37 
 
 		 273 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.32 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  25 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  28.03 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  26.24 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  26.21 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  25.18 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  28.97 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  25.98 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  27.31 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  24.37 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  23.58 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  23.99 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  23.41 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  23.39 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  27.8 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.39 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  22.02 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  29.14 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  27.93 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  27.17 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  23 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  24.32 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  26.7 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  25.4 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  24.41 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  29.33 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  22.53 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  27.93 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  22.53 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  22.53 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  23.39 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  21.79 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  22.43 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  27.17 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  25.26 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  27.48 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  22.13 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 392 aa  62.4  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  25.79 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  22.26 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  27.32 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  21.25 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  22.07 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  25.55 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  23.7 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  25.79 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  24.3 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  23.58 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  23.6 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  22.41 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  22.11 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  23.6 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  24.19 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  24.02 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  24.41 
 
 		 884 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  22.41 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  23.26 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  23.15 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  21.49 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  23.36 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  26.77 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0286  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  22 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2218  amidohydrolase 2  21.72 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.0155453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  22.64 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  25.67 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  23 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4067  amidohydrolase 2  25.64 
 
 		 373 aa  52.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.186813  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  25.53 
 
 		 294 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 338 aa  52.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0404  amidohydrolase 2  24.34 
 
 		 415 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.826909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  22.62 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1101  amidohydrolase 2  25.88 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  25.4 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  20.78 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  23.29 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  22.45 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  26.2 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3555  amidohydrolase 2  23.78 
 
 		 348 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  21.48 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  22.13 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  21.77 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3877  amidohydrolase 2  23.31 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  23.24 
 
 		 347 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0887  putative mannonate dehydratase  22.98 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  22.67 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3364  amidohydrolase 2  24.15 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>