74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3770 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3770  amidohydrolase 2  100 
 
 
309 aa  637    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115169  normal  0.264283 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5784  amidohydrolase 2  34 
 
 
283 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  26.95 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3267  amidohydrolase 2  27.07 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  unclonable  0.0000314139 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3277  amidohydrolase 2  26.71 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257981 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1021  hypothetical protein  22.36 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643261  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43770  predicted protein  24.84 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.02958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  29.95 
 
 
275 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  27.3 
 
 
272 aa  62.8  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  26.6 
 
 
277 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  24.45 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  24.45 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  27.1 
 
 
279 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  24.23 
 
 
272 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1804  hypothetical protein  21.75 
 
 
329 aa  56.6  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  25.86 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  24.52 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  25.36 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  25.47 
 
 
295 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  28.04 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  28.04 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  28.04 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  28.04 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  28.04 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  26.59 
 
 
291 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  26.59 
 
 
291 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  28.04 
 
 
279 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  26.1 
 
 
290 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  24.52 
 
 
276 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
276 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  25.97 
 
 
348 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  26.59 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  23.44 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  26.13 
 
 
300 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  24.44 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43937  predicted protein  23.02 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00956853  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  23.57 
 
 
284 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  22.73 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  36.04 
 
 
348 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  25.41 
 
 
290 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  25 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  20.36 
 
 
312 aa  47  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  27.37 
 
 
335 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  25.68 
 
 
314 aa  46.2  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  24.6 
 
 
289 aa  46.2  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  24.6 
 
 
275 aa  46.2  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
290 aa  45.8  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  25.86 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5782  amidohydrolase 2  24.37 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  30.28 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  23.1 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  29.49 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  27.23 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  26.45 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  24.35 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  23.95 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  24.28 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  25.19 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  23.68 
 
 
276 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  25.19 
 
 
319 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  25.19 
 
 
319 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  25.19 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  23.75 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
261 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  25.16 
 
 
307 aa  43.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3877  amidohydrolase 2  24.18 
 
 
289 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  27.56 
 
 
270 aa  42.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  26.46 
 
 
288 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  27.11 
 
 
277 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  25.75 
 
 
297 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  22.46 
 
 
287 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>