94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09180 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_09180  Amidohydrolase 2  100 
 
 
325 aa  641    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  29.93 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  27.27 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  28.92 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  27.21 
 
 
282 aa  79  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  29.2 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  28.32 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  27.56 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  25.52 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  27.34 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  25.6 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  27.11 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  31.72 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  25.8 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  31.72 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  31.72 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  31.72 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  26.06 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  27.18 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  28.28 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  27.92 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  27.53 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  31.72 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  31.72 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  24.4 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  28.08 
 
 
288 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  26.3 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  28.52 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  28.17 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  31 
 
 
280 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  29.82 
 
 
260 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  28.66 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  27.02 
 
 
290 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  27.57 
 
 
281 aa  62.4  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  26.74 
 
 
276 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  29.17 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  26.25 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  24.07 
 
 
291 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  21.63 
 
 
278 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  25.6 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  28.29 
 
 
275 aa  57  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
296 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
296 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  24.5 
 
 
291 aa  56.2  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  25.71 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  24.41 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
296 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
277 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  24.26 
 
 
304 aa  53.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  21.88 
 
 
275 aa  52.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  26.53 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  27.8 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  29.34 
 
 
285 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  26.87 
 
 
284 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  30.34 
 
 
281 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  26.13 
 
 
272 aa  49.7  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  24.29 
 
 
287 aa  49.7  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  24.9 
 
 
276 aa  49.3  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  27.82 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  27.21 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  26.21 
 
 
296 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  23.59 
 
 
279 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  23.32 
 
 
290 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  29.84 
 
 
296 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  25.16 
 
 
302 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  35.24 
 
 
345 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  23.84 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  27.73 
 
 
280 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  27.34 
 
 
280 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  31.49 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  28.85 
 
 
297 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  25.96 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  31.49 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  28.12 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  25.96 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  24.33 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  28.17 
 
 
308 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  23.77 
 
 
360 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  25.43 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  26.1 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1447  hypothetical protein  25.93 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3800  amidohydrolase 2  28.41 
 
 
281 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0537  hypothetical protein  21.48 
 
 
256 aa  43.5  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0233364  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
277 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  27.24 
 
 
272 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  28.14 
 
 
291 aa  43.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  26.61 
 
 
320 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  28.96 
 
 
339 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  27.49 
 
 
307 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  28.79 
 
 
275 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  27.91 
 
 
322 aa  42.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>