97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3428 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  100 
 
 		 309 aa  647    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  83.67 
 
 		 318 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  84.23 
 
 		 300 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  83.89 
 
 		 300 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  83.56 
 
 		 300 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  79.26 
 
 		 308 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  65.89 
 
 		 308 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  67.11 
 
 		 310 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  64.88 
 
 		 301 aa  421  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  64.09 
 
 		 301 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  63.55 
 
 		 304 aa  411  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  63.76 
 
 		 301 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  29.89 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  25.1 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  25.11 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  25.89 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  27.11 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  27.81 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  23.42 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  27.88 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  27.19 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  29.79 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  26.87 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  24.46 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  29.27 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  26.11 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  23.89 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  27.75 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  25.45 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  24.1 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  25.55 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  25.99 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  25.21 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  26.41 
 
 		 332 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  24.8 
 
 		 269 aa  53.1  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  25.89 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  25 
 
 		 381 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  25.55 
 
 		 293 aa  52.8  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  22.52 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6909  amidohydrolase 2  28.12 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  26.82 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  30.56 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  24.63 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  25.58 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  30.43 
 
 		 392 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  30.37 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  22.94 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  26.11 
 
 		 286 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 278 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1804  hypothetical protein  24.03 
 
 		 329 aa  49.3  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  22.66 
 
 		 258 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  24.19 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  26.44 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  25.14 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  28.98 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  26.44 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  26.44 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  27.16 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  25.54 
 
 		 282 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1919  amidohydrolase 2  23.03 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.414859  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  25 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  22.55 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  24.76 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  26.27 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43770  predicted protein  20.36 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.02958  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  22.94 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2151  amidohydrolase 2  27.81 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  23.86 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04819  Protein fluG [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38094]  24.86 
 
 		 865 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385753  normal  0.68223 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  25.41 
 
 		 266 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  22.97 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  24.31 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  25.93 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0925  putative transducer (chemotactic transducer pcta)  26.2 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00204533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  24.34 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  28.23 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  28.5 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  22.87 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  24.58 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  30.84 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  24.08 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  22.76 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  24.11 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  26.37 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  25.49 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2949  amidohydrolase 2  24.63 
 
 		 379 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  21.16 
 
 		 333 aa  42.7  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  24.88 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  23.5 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>