40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0925 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0925  putative transducer (chemotactic transducer pcta)  100 
 
 		 263 aa  546  1e-154  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00204533  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  25.09 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6909  amidohydrolase 2  24 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  21.99 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  23.81 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  30.13 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  26.87 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1919  amidohydrolase 2  23.37 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.414859  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  30.27 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  29.76 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  25.82 
 
 		 387 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  22.38 
 
 		 316 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.41 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  24.88 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  26.92 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 300 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  24 
 
 		 290 aa  46.2  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  23.67 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  26.54 
 
 		 358 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  25.36 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  26.44 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  25.36 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  26.2 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  24.15 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  25 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  25.93 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  23.67 
 
 		 310 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  27.39 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  21.95 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  22.53 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  22.95 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  25.49 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  24.9 
 
 		 381 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  27.52 
 
 		 280 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  22.22 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>