60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7142 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  100 
 
 		 318 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  84.9 
 
 		 300 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  83.67 
 
 		 309 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  82.89 
 
 		 300 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  82.21 
 
 		 300 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  80.94 
 
 		 308 aa  529  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  69.23 
 
 		 308 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  67.31 
 
 		 310 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  68.9 
 
 		 301 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  68.46 
 
 		 301 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  66.34 
 
 		 304 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  67.11 
 
 		 301 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  29.44 
 
 		 245 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  28.16 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  28.31 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  28.78 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  30 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  24.66 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  24.49 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  27.11 
 
 		 387 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  26.98 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  27.4 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  25.22 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  22.67 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  21.96 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  24.69 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  26.62 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 264 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  27.16 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 262 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  27.56 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  25.64 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  27.57 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  26.63 
 
 		 266 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  23.79 
 
 		 294 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  27.57 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  28.24 
 
 		 381 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  26.19 
 
 		 269 aa  46.2  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  25.21 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  27.15 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  27.01 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  25.53 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  21.53 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  27.68 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  25.41 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  25.56 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  22.48 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  25.64 
 
 		 282 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  24.06 
 
 		 392 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  25.6 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  24.44 
 
 		 307 aa  43.5  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0925  putative transducer (chemotactic transducer pcta)  25.49 
 
 		 263 aa  43.5  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00204533  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  26.52 
 
 		 262 aa  43.5  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  25.22 
 
 		 334 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6909  amidohydrolase 2  26.7 
 
 		 266 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  22.84 
 
 		 276 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>