94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3429 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  100 
 
 		 301 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  90.7 
 
 		 301 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  89.7 
 
 		 301 aa  577  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  89.67 
 
 		 304 aa  573  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  89.37 
 
 		 308 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  88.67 
 
 		 310 aa  565  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  69.21 
 
 		 308 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  67.11 
 
 		 318 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  65 
 
 		 300 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  64 
 
 		 300 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  63 
 
 		 300 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  63.76 
 
 		 309 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  35.24 
 
 		 245 aa  89  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  31.3 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  27.11 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  25.79 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  28.12 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  27.89 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  23.64 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  26.72 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  25.34 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  30.23 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  24.87 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  26.58 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  22.13 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  28.66 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  29.02 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  25.65 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  23.44 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  23.94 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  25.11 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  25.57 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  28.7 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  27.04 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  24.66 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  25 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  25.82 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  27.38 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  27.01 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  24.28 
 
 		 392 aa  52.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  27.92 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 264 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6909  amidohydrolase 2  23.5 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  23.26 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  30.05 
 
 		 285 aa  49.3  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  23.84 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  26.53 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  29.19 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  25.57 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  29.6 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  22.18 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  26.56 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 358 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  24.28 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  22.32 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  21.78 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  23.71 
 
 		 271 aa  46.6  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  23.58 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  30.36 
 
 		 351 aa  46.2  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  25.27 
 
 		 334 aa  46.2  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  21.89 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  21.89 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  23.23 
 
 		 289 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  26.37 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  24.91 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  25.37 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  24.61 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  22.75 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.56 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0925  putative transducer (chemotactic transducer pcta)  27.27 
 
 		 263 aa  44.3  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00204533  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  26.01 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1804  hypothetical protein  23.21 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  23.41 
 
 		 364 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  26.61 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  22.48 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  23.36 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  28.48 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  26.96 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 344 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.779648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>