85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3739 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  100 
 
 
364 aa  751    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  78.19 
 
 
353 aa  578  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  60.62 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  58.28 
 
 
345 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  58.23 
 
 
341 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  58.7 
 
 
344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  55.93 
 
 
346 aa  401  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  56.47 
 
 
340 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  51.64 
 
 
340 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  51.34 
 
 
340 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  56.83 
 
 
345 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  51.56 
 
 
347 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3555  amidohydrolase 2  53.14 
 
 
348 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202032  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  52.8 
 
 
336 aa  355  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  48.32 
 
 
309 aa  332  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2429  amidohydrolase 2  50.8 
 
 
320 aa  308  9e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.067263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  35.08 
 
 
334 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  34.76 
 
 
334 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  33.85 
 
 
334 aa  205  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  34.95 
 
 
333 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2859  amidohydrolase 2  26.43 
 
 
358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0625  amidohydrolase 2  27.42 
 
 
491 aa  93.2  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  26.54 
 
 
332 aa  89.4  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1110  amidohydrolase 2  30.3 
 
 
498 aa  85.9  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1765  amidohydrolase 2  27.38 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2056  amidohydrolase 2  30.63 
 
 
508 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153569  hitchhiker  0.000000238933 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  27.43 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  27.23 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  25.68 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26.7 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  24.79 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  24.58 
 
 
287 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  26.6 
 
 
287 aa  60.1  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  25 
 
 
308 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  23.5 
 
 
289 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  26.24 
 
 
293 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  24.1 
 
 
304 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  23.96 
 
 
289 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
288 aa  56.2  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1136  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
497 aa  56.2  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  23.93 
 
 
289 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  29.61 
 
 
279 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
291 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  22.55 
 
 
294 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  23.04 
 
 
289 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  26.47 
 
 
295 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  27.92 
 
 
307 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  23.85 
 
 
301 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  27.59 
 
 
287 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  23.83 
 
 
297 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  24.29 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  24.4 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  23.7 
 
 
301 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  22.77 
 
 
277 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  25.08 
 
 
308 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  23.71 
 
 
289 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  22.32 
 
 
293 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  23.04 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  29.23 
 
 
270 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  29.23 
 
 
278 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  22.19 
 
 
288 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
300 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  26.27 
 
 
288 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  23.65 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  25.35 
 
 
387 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  24.27 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  25.13 
 
 
291 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
298 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
298 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
298 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  20.83 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  24.86 
 
 
279 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  27.47 
 
 
294 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
312 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
301 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
278 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  23.85 
 
 
300 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  25.38 
 
 
286 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  24.67 
 
 
300 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  23.39 
 
 
318 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  24.83 
 
 
295 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  23.49 
 
 
287 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  25 
 
 
294 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>