27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2056 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1110  amidohydrolase 2  70.16 
 
 		 498 aa  725    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2056  amidohydrolase 2  100 
 
 		 508 aa  1057    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153569  hitchhiker  0.000000238933 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1136  amidohydrolase 2  49 
 
 		 497 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0625  amidohydrolase 2  31.45 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1765  amidohydrolase 2  31.74 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  27 
 
 		 340 aa  106  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  27.42 
 
 		 338 aa  94.7  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  27.32 
 
 		 340 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  27.32 
 
 		 340 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  30.38 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  27.73 
 
 		 334 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  31.82 
 
 		 353 aa  82.8  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  30.37 
 
 		 334 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  27.31 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  27.39 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  27.72 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  32.02 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3555  amidohydrolase 2  29.51 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202032  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  30.63 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  32.86 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  31.5 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  33.01 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  31.38 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2429  amidohydrolase 2  27.8 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.067263  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2859  amidohydrolase 2  23.67 
 
 		 358 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  28.48 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>