72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2287 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  100 
 
 		 309 aa  645    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  74.77 
 
 		 347 aa  520  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  72.26 
 
 		 336 aa  501  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3555  amidohydrolase 2  67.28 
 
 		 348 aa  457  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  63.94 
 
 		 346 aa  408  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  60.18 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  61.52 
 
 		 345 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  57.89 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  55.93 
 
 		 341 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  55.42 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  52.63 
 
 		 340 aa  348  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  52.63 
 
 		 340 aa  348  9e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  50.31 
 
 		 340 aa  338  5e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  46.79 
 
 		 353 aa  320  9.999999999999999e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  48.32 
 
 		 364 aa  320  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2429  amidohydrolase 2  47.12 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.067263  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  32.47 
 
 		 334 aa  169  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  31.62 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 334 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  29.69 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2859  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1110  amidohydrolase 2  32.98 
 
 		 498 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2056  amidohydrolase 2  32.02 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153569  hitchhiker  0.000000238933 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0625  amidohydrolase 2  27.75 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1765  amidohydrolase 2  28.81 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  28.62 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  25.56 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  26.99 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  26.2 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  26.24 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  25.36 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  22.18 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  23.56 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1136  amidohydrolase 2  27.93 
 
 		 497 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  29.02 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  23.97 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  24.78 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  22.37 
 
 		 276 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 288 aa  52.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  22.77 
 
 		 277 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  23.89 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  28.7 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.1 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  20.78 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  25.19 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  23.18 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  22.36 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  27.41 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  25.36 
 
 		 270 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  22.43 
 
 		 286 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  21.56 
 
 		 278 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  23.01 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  21 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  27.98 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  29.75 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  25.55 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  25.88 
 
 		 307 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  24.1 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  24.41 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  28.1 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  27.98 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  25.86 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  26.4 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  26.4 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  23.48 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  29.91 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  22.08 
 
 		 279 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>