86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1377 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  100 
 
 
340 aa  705    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  75.29 
 
 
340 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  75 
 
 
340 aa  557  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  68.84 
 
 
338 aa  504  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  64.31 
 
 
341 aa  478  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  65.36 
 
 
345 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  60.96 
 
 
344 aa  429  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  58.55 
 
 
345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  59.17 
 
 
346 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  55.45 
 
 
347 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  55.59 
 
 
353 aa  389  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  56.56 
 
 
336 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  56.07 
 
 
364 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3555  amidohydrolase 2  55.91 
 
 
348 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202032  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  50.16 
 
 
309 aa  341  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2429  amidohydrolase 2  49.53 
 
 
320 aa  299  5e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.067263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  38.11 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
334 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  37.16 
 
 
334 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  34.74 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2859  amidohydrolase 2  27.05 
 
 
358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1110  amidohydrolase 2  28.8 
 
 
498 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2056  amidohydrolase 2  27 
 
 
508 aa  106  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153569  hitchhiker  0.000000238933 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  32.76 
 
 
332 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1765  amidohydrolase 2  29.3 
 
 
440 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0625  amidohydrolase 2  23.39 
 
 
491 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1136  amidohydrolase 2  25.08 
 
 
497 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  28.4 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  26.16 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  24.53 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  26.73 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  27.15 
 
 
312 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  24.11 
 
 
286 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  26.32 
 
 
294 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  29.76 
 
 
307 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  26.39 
 
 
289 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26.17 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
289 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  25.46 
 
 
289 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  26.56 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  25.11 
 
 
293 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  22.94 
 
 
277 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  26.87 
 
 
293 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  25.37 
 
 
381 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  24.58 
 
 
300 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  25.3 
 
 
287 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  26.09 
 
 
287 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  24.21 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  23.91 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  24.21 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
291 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  22.75 
 
 
289 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  26.26 
 
 
286 aa  53.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  21.9 
 
 
276 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  30.3 
 
 
295 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  21.8 
 
 
278 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  25.22 
 
 
279 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  25.32 
 
 
287 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  24.79 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  31.2 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  24.35 
 
 
287 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  26.84 
 
 
282 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  23.56 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  24.02 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  27.48 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  28.07 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  28.47 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  26.84 
 
 
282 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  32.23 
 
 
269 aa  47  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  27.18 
 
 
300 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  22.94 
 
 
293 aa  46.6  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  25 
 
 
277 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  22.46 
 
 
288 aa  46.2  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  25.69 
 
 
279 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  31.86 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  23.56 
 
 
283 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  26.11 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  24.76 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  27.2 
 
 
286 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  27.37 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  28.14 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  25 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.76 
 
 
300 aa  42.7  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  24.24 
 
 
345 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>