45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2859 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2859  amidohydrolase 2  100 
 
 		 358 aa  734    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  37.61 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  36.12 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  36.25 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  34.13 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 338 aa  139  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  29.36 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  29.05 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  28.05 
 
 		 341 aa  132  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  27.69 
 
 		 345 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  25.45 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 340 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  27.67 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  26.88 
 
 		 345 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  27.1 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  25.72 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2429  amidohydrolase 2  23.92 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.067263  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3555  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  25.47 
 
 		 346 aa  93.2  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  26.46 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0625  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2056  amidohydrolase 2  23.67 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153569  hitchhiker  0.000000238933 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1765  amidohydrolase 2  27.1 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  28.07 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1110  amidohydrolase 2  25.97 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  28.93 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  24.54 
 
 		 277 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  25.22 
 
 		 276 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1136  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 497 aa  53.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 246 aa  53.1  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  27.66 
 
 		 307 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  30.05 
 
 		 282 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  30.05 
 
 		 282 aa  50.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  23.91 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  25 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  28.47 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  29.44 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  24.17 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43770  predicted protein  23.64 
 
 		 327 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.02958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1919  amidohydrolase 2  28.8 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.414859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  22.17 
 
 		 276 aa  43.9  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  26.53 
 
 		 312 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>