92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2309 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  100 
 
 		 285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  70.42 
 
 		 884 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  63.93 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  62.28 
 
 		 311 aa  364  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  62.28 
 
 		 297 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  62.06 
 
 		 333 aa  352  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  59.86 
 
 		 301 aa  343  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  59.51 
 
 		 297 aa  338  8e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  57.39 
 
 		 297 aa  330  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  58.87 
 
 		 296 aa  328  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  58.6 
 
 		 309 aa  328  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  56.74 
 
 		 308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  53.71 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  53.6 
 
 		 289 aa  287  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  30.71 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  35.64 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  27.83 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  27.04 
 
 		 341 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  27.04 
 
 		 385 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  26.71 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  26.37 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  31.69 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  22.45 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  21.28 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  31.09 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  30.57 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  30.05 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  29.53 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  24.14 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  29.53 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  31.15 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  30.05 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  28.89 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  34 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  31.16 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  30.97 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  28.64 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  23.58 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  25 
 
 		 297 aa  52.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  30.32 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  26.77 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  30.97 
 
 		 270 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  29.68 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  28.04 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  29.59 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  35.29 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  24.07 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  25.98 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  26.23 
 
 		 283 aa  49.3  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  23.56 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  21.52 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  24.51 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  29.03 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  27.22 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  22.5 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  24.16 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  28.99 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  24.09 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  24.32 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4473  amidohydrolase 2  22.13 
 
 		 276 aa  46.2  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  27.22 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  24.91 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  26.23 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  23.75 
 
 		 287 aa  45.8  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0286  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  24.17 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  25.39 
 
 		 332 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  23.75 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  28.67 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  22.63 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  25.55 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  24.56 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  24.41 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  26.25 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  26.23 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  29.61 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  24.65 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  24.57 
 
 		 262 aa  42.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  24.83 
 
 		 285 aa  42.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>