88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3966 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  100 
 
 
884 aa  1816    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  70.42 
 
 
285 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  58.47 
 
 
308 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  58.31 
 
 
301 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  60.07 
 
 
297 aa  363  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  60.22 
 
 
311 aa  356  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  59.2 
 
 
333 aa  346  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  59.03 
 
 
296 aa  335  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  58.28 
 
 
297 aa  330  9e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  57.59 
 
 
297 aa  326  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  54.88 
 
 
309 aa  320  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  53.36 
 
 
358 aa  307  7e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  52.16 
 
 
308 aa  290  6e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  49.29 
 
 
289 aa  273  7e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1631  hypothetical protein  26.84 
 
 
594 aa  171  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000289868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0570  hypothetical protein  26.36 
 
 
621 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407962  normal  0.128274 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5058  hypothetical protein  26.54 
 
 
564 aa  149  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2639  hypothetical protein  24.07 
 
 
573 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0014587  decreased coverage  1.98155e-17 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4211  hypothetical protein  29.9 
 
 
323 aa  127  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.755848  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  30.33 
 
 
300 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  26.57 
 
 
279 aa  107  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2826  hypothetical protein  24.11 
 
 
659 aa  103  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.16509  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  34.16 
 
 
268 aa  100  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0910  hypothetical protein  23.1 
 
 
570 aa  92.4  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0685  hypothetical protein  21.13 
 
 
571 aa  89.4  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  27.56 
 
 
341 aa  89.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  27.69 
 
 
341 aa  88.2  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  27.69 
 
 
385 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  27.69 
 
 
341 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1573  hypothetical protein  26.67 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2741  hypothetical protein  24.88 
 
 
559 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000033035  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  30.98 
 
 
297 aa  70.5  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2605  hypothetical protein  25.45 
 
 
583 aa  68.9  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
285 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4527  hypothetical protein  26.24 
 
 
427 aa  66.6  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.833765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  30.65 
 
 
293 aa  65.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  27.17 
 
 
293 aa  64.7  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  27.01 
 
 
289 aa  63.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  29.47 
 
 
283 aa  63.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1573  hypothetical protein  27.8 
 
 
558 aa  62.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.580118  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1231  Abortive phage infection  28.66 
 
 
567 aa  61.2  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  28.1 
 
 
278 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
275 aa  60.1  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  24.41 
 
 
288 aa  58.5  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
293 aa  58.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  26.82 
 
 
298 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  26.82 
 
 
298 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  26.82 
 
 
298 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  24.44 
 
 
286 aa  57.4  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  24.16 
 
 
287 aa  57  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1444  hypothetical protein  29.63 
 
 
583 aa  56.6  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
270 aa  55.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  30.38 
 
 
287 aa  55.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  27.76 
 
 
279 aa  55.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  31.85 
 
 
303 aa  55.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2746  hypothetical protein  29.55 
 
 
699 aa  54.7  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  27.08 
 
 
300 aa  54.7  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1325  hypothetical protein  30.14 
 
 
564 aa  53.9  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1808  hypothetical protein  40.26 
 
 
587 aa  53.9  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00269931  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
294 aa  53.9  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  24.29 
 
 
289 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  25.56 
 
 
295 aa  53.5  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  30 
 
 
279 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  30.56 
 
 
287 aa  52.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
294 aa  52.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  27.45 
 
 
297 aa  51.6  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23140  hypothetical protein  31.78 
 
 
549 aa  51.6  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  29.86 
 
 
287 aa  51.6  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0195  hypothetical protein  31.9 
 
 
589 aa  51.6  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.520308  normal  0.0593303 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0767  abortive infection phage resistance protein  29.22 
 
 
567 aa  51.2  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  28.42 
 
 
277 aa  50.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  22.6 
 
 
291 aa  49.3  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26.03 
 
 
291 aa  48.9  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1575  hypothetical protein  22.46 
 
 
246 aa  48.5  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  22.48 
 
 
310 aa  47.8  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0404  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
415 aa  47  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.826909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  22.35 
 
 
288 aa  47.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  26.23 
 
 
283 aa  47  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
269 aa  47.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  25.53 
 
 
293 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  26.97 
 
 
299 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  32.77 
 
 
255 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2699  Abortive phage infection  28.07 
 
 
571 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  25.78 
 
 
287 aa  45.8  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  29.45 
 
 
305 aa  45.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4170  hypothetical protein  31.25 
 
 
571 aa  45.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0280  hypothetical protein  27.78 
 
 
602 aa  45.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2265  hypothetical protein  29.34 
 
 
708 aa  44.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0442234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>