38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4170 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4170  hypothetical protein  100 
 
 		 571 aa  1181    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3657  abortive infection phage resistance protein, putative  39.1 
 
 		 583 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00483557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0934  hypothetical protein  36.77 
 
 		 587 aa  354  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0606328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2679  hypothetical protein  29.14 
 
 		 554 aa  187  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000692051  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0341  hypothetical protein  27.98 
 
 		 599 aa  171  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2523  hypothetical protein  29.8 
 
 		 572 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23140  hypothetical protein  26.75 
 
 		 549 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2265  hypothetical protein  28.44 
 
 		 708 aa  137  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0442234  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1771  hypothetical protein  23.44 
 
 		 591 aa  114  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241962  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1326  hypothetical protein  27.65 
 
 		 588 aa  113  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330951  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0767  abortive infection phage resistance protein  23.09 
 
 		 567 aa  90.9  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1325  hypothetical protein  26.02 
 
 		 564 aa  87.8  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2699  Abortive phage infection  25.31 
 
 		 571 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1444  hypothetical protein  24.66 
 
 		 583 aa  77.4  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0311  hypothetical protein  24.14 
 
 		 628 aa  77.4  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0009  hypothetical protein  28.97 
 
 		 589 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0195  hypothetical protein  30.86 
 
 		 589 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.520308  normal  0.0593303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2090  hypothetical protein  30.99 
 
 		 600 aa  64.3  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0662343  normal  0.183735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3074  hypothetical protein  29.25 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0280  hypothetical protein  27.27 
 
 		 602 aa  61.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2826  hypothetical protein  25.16 
 
 		 659 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.16509  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2605  hypothetical protein  23.55 
 
 		 583 aa  55.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2370  hypothetical protein  24.67 
 
 		 706 aa  54.3  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2741  hypothetical protein  22.47 
 
 		 559 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000033035  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1808  hypothetical protein  22.39 
 
 		 587 aa  52.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00269931  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4211  hypothetical protein  23.27 
 
 		 323 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.755848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0752  Abortive phage infection  26.88 
 
 		 684 aa  51.2  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2639  hypothetical protein  30.17 
 
 		 573 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0014587  decreased coverage  1.98155e-17 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1249  hypothetical protein  24.46 
 
 		 658 aa  49.7  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0525958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2746  hypothetical protein  27.78 
 
 		 699 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0938  hypothetical protein  20.63 
 
 		 672 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1573  hypothetical protein  24.92 
 
 		 558 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.580118  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0685  hypothetical protein  27.07 
 
 		 571 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4269  hypothetical protein  25.69 
 
 		 654 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0571  hypothetical protein  25.31 
 
 		 661 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 884 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0910  hypothetical protein  27.54 
 
 		 570 aa  44.3  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0570  hypothetical protein  23.86 
 
 		 621 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407962  normal  0.128274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>