31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0938 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0938  hypothetical protein  100 
 
 
672 aa  1371    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0752  Abortive phage infection  35.07 
 
 
684 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0571  hypothetical protein  30.83 
 
 
661 aa  347  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4269  hypothetical protein  31.44 
 
 
654 aa  313  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1249  hypothetical protein  31.92 
 
 
658 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0525958  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2746  hypothetical protein  28.1 
 
 
699 aa  271  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0280  hypothetical protein  29.96 
 
 
602 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2370  hypothetical protein  32.36 
 
 
706 aa  245  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2090  hypothetical protein  27.73 
 
 
600 aa  240  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0662343  normal  0.183735 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0009  hypothetical protein  28.14 
 
 
589 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101809  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3074  hypothetical protein  28.7 
 
 
594 aa  232  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1631  hypothetical protein  26.6 
 
 
594 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000289868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2639  hypothetical protein  25.43 
 
 
573 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0014587  decreased coverage  1.98155e-17 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1444  hypothetical protein  31.41 
 
 
583 aa  65.1  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2605  hypothetical protein  26.29 
 
 
583 aa  62  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1326  hypothetical protein  29.81 
 
 
588 aa  61.6  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330951  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0311  hypothetical protein  24.83 
 
 
628 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5058  hypothetical protein  31.43 
 
 
564 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2826  hypothetical protein  25.21 
 
 
659 aa  58.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.16509  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0767  abortive infection phage resistance protein  26.42 
 
 
567 aa  55.5  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1325  hypothetical protein  23.83 
 
 
564 aa  53.5  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0195  hypothetical protein  29.71 
 
 
589 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.520308  normal  0.0593303 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3657  abortive infection phage resistance protein, putative  21.74 
 
 
583 aa  51.6  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00483557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0934  hypothetical protein  20.5 
 
 
587 aa  50.8  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0606328  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4211  hypothetical protein  27.5 
 
 
323 aa  50.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.755848  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1771  hypothetical protein  26.98 
 
 
591 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241962  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1573  hypothetical protein  25 
 
 
558 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.580118  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0341  hypothetical protein  27.59 
 
 
599 aa  48.1  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1808  hypothetical protein  30 
 
 
587 aa  47  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00269931  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4170  hypothetical protein  20.63 
 
 
571 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4527  hypothetical protein  24.26 
 
 
427 aa  44.3  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.833765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>