40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2090 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2090  hypothetical protein  100 
 
 		 600 aa  1243    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0662343  normal  0.183735 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0009  hypothetical protein  46.72 
 
 		 589 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0280  hypothetical protein  43.61 
 
 		 602 aa  524  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3074  hypothetical protein  42.19 
 
 		 594 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2746  hypothetical protein  34.97 
 
 		 699 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0752  Abortive phage infection  33.39 
 
 		 684 aa  300  7e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0571  hypothetical protein  31.79 
 
 		 661 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0938  hypothetical protein  27.73 
 
 		 672 aa  240  5.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4269  hypothetical protein  29.43 
 
 		 654 aa  236  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1249  hypothetical protein  30.88 
 
 		 658 aa  230  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0525958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2370  hypothetical protein  25.39 
 
 		 706 aa  227  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1771  hypothetical protein  31.98 
 
 		 591 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1325  hypothetical protein  28.12 
 
 		 564 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0195  hypothetical protein  31.85 
 
 		 589 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.520308  normal  0.0593303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2826  hypothetical protein  26.98 
 
 		 659 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.16509  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1444  hypothetical protein  26.28 
 
 		 583 aa  77.4  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0767  abortive infection phage resistance protein  29.82 
 
 		 567 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0934  hypothetical protein  31.52 
 
 		 587 aa  73.9  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0606328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3657  abortive infection phage resistance protein, putative  32.12 
 
 		 583 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00483557  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1631  hypothetical protein  23.72 
 
 		 594 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000289868  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2523  hypothetical protein  29.59 
 
 		 572 aa  68.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2679  hypothetical protein  32.68 
 
 		 554 aa  66.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000692051  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4211  hypothetical protein  28.95 
 
 		 323 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.755848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0341  hypothetical protein  28.33 
 
 		 599 aa  65.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2605  hypothetical protein  29.09 
 
 		 583 aa  64.3  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4170  hypothetical protein  30.99 
 
 		 571 aa  64.3  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23140  hypothetical protein  36.03 
 
 		 549 aa  61.6  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1326  hypothetical protein  27.46 
 
 		 588 aa  59.7  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330951  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4527  hypothetical protein  23.35 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.833765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2699  Abortive phage infection  28.21 
 
 		 571 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2639  hypothetical protein  29.52 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0014587  decreased coverage  1.98155e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2741  hypothetical protein  25.86 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000033035  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0685  hypothetical protein  28.74 
 
 		 571 aa  56.6  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5058  hypothetical protein  28.44 
 
 		 564 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1808  hypothetical protein  31.21 
 
 		 587 aa  55.1  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00269931  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2265  hypothetical protein  31.16 
 
 		 708 aa  53.9  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0442234  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1573  hypothetical protein  26.94 
 
 		 558 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.580118  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0910  hypothetical protein  31.03 
 
 		 570 aa  53.5  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0311  hypothetical protein  25.1 
 
 		 628 aa  53.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1231  Abortive phage infection  29.5 
 
 		 567 aa  44.7  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>