35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2523 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2523  hypothetical protein  100 
 
 		 572 aa  1182    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2679  hypothetical protein  34.06 
 
 		 554 aa  312  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000692051  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1326  hypothetical protein  29.74 
 
 		 588 aa  248  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330951  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23140  hypothetical protein  32.4 
 
 		 549 aa  247  4e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1771  hypothetical protein  27.16 
 
 		 591 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2265  hypothetical protein  25.39 
 
 		 708 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0442234  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0341  hypothetical protein  29.03 
 
 		 599 aa  182  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0934  hypothetical protein  30.1 
 
 		 587 aa  177  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0606328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3657  abortive infection phage resistance protein, putative  30.26 
 
 		 583 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00483557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4170  hypothetical protein  29.8 
 
 		 571 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0195  hypothetical protein  28.5 
 
 		 589 aa  98.2  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.520308  normal  0.0593303 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0311  hypothetical protein  24.34 
 
 		 628 aa  87  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1325  hypothetical protein  22.95 
 
 		 564 aa  76.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2746  hypothetical protein  32.12 
 
 		 699 aa  75.1  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4269  hypothetical protein  29.95 
 
 		 654 aa  73.9  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0009  hypothetical protein  29.45 
 
 		 589 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0767  abortive infection phage resistance protein  27.12 
 
 		 567 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0280  hypothetical protein  29.41 
 
 		 602 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2090  hypothetical protein  29.59 
 
 		 600 aa  68.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0662343  normal  0.183735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3074  hypothetical protein  30.41 
 
 		 594 aa  67.8  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1808  hypothetical protein  22.58 
 
 		 587 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00269931  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1444  hypothetical protein  22.03 
 
 		 583 aa  60.8  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1249  hypothetical protein  27.91 
 
 		 658 aa  60.5  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0525958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0752  Abortive phage infection  27.92 
 
 		 684 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2370  hypothetical protein  26.8 
 
 		 706 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2699  Abortive phage infection  26.94 
 
 		 571 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4527  hypothetical protein  29.95 
 
 		 427 aa  57  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.833765  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1573  hypothetical protein  31.12 
 
 		 558 aa  54.3  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.580118  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2826  hypothetical protein  26.28 
 
 		 659 aa  51.6  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.16509  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3935  hypothetical protein  37.33 
 
 		 72 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2741  hypothetical protein  39.47 
 
 		 559 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000033035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0571  hypothetical protein  25.9 
 
 		 661 aa  47.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0910  hypothetical protein  26.55 
 
 		 570 aa  45.4  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2605  hypothetical protein  26.95 
 
 		 583 aa  44.3  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1631  hypothetical protein  29.79 
 
 		 594 aa  43.9  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000289868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>