42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1325 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1325  hypothetical protein  100 
 
 
564 aa  1164    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2699  Abortive phage infection  53.53 
 
 
571 aa  594  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0767  abortive infection phage resistance protein  51.94 
 
 
567 aa  585  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2605  hypothetical protein  28.33 
 
 
583 aa  145  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1573  hypothetical protein  28.57 
 
 
558 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.580118  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4527  hypothetical protein  28.1 
 
 
427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.833765  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0341  hypothetical protein  26.76 
 
 
599 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3657  abortive infection phage resistance protein, putative  24.85 
 
 
583 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00483557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2679  hypothetical protein  21.55 
 
 
554 aa  89.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000692051  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4170  hypothetical protein  26.02 
 
 
571 aa  87.8  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2265  hypothetical protein  25.15 
 
 
708 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0442234  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3074  hypothetical protein  34.12 
 
 
594 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1444  hypothetical protein  22.65 
 
 
583 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0934  hypothetical protein  22.89 
 
 
587 aa  82.8  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0606328  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0571  hypothetical protein  37.27 
 
 
661 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0195  hypothetical protein  24.59 
 
 
589 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.520308  normal  0.0593303 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23140  hypothetical protein  25.12 
 
 
549 aa  81.3  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2090  hypothetical protein  28.12 
 
 
600 aa  80.5  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0662343  normal  0.183735 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1808  hypothetical protein  24.32 
 
 
587 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00269931  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1231  Abortive phage infection  23.33 
 
 
567 aa  80.1  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2523  hypothetical protein  22.95 
 
 
572 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0910  hypothetical protein  28.5 
 
 
570 aa  75.1  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1326  hypothetical protein  28.85 
 
 
588 aa  73.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330951  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0009  hypothetical protein  30.72 
 
 
589 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101809  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2826  hypothetical protein  22.85 
 
 
659 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.16509  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2746  hypothetical protein  30.12 
 
 
699 aa  70.5  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2370  hypothetical protein  32.45 
 
 
706 aa  70.1  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1771  hypothetical protein  24.12 
 
 
591 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241962  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0311  hypothetical protein  28.1 
 
 
628 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1249  hypothetical protein  29.8 
 
 
658 aa  69.3  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0525958  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0280  hypothetical protein  32.03 
 
 
602 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0752  Abortive phage infection  33.33 
 
 
684 aa  67.8  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4269  hypothetical protein  31.87 
 
 
654 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0570  hypothetical protein  21.6 
 
 
621 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407962  normal  0.128274 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2639  hypothetical protein  28.44 
 
 
573 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0014587  decreased coverage  1.98155e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2741  hypothetical protein  25.58 
 
 
559 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000033035  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0685  hypothetical protein  24.35 
 
 
571 aa  58.9  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4211  hypothetical protein  24.39 
 
 
323 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.755848  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5058  hypothetical protein  23.4 
 
 
564 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1631  hypothetical protein  26.17 
 
 
594 aa  54.3  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000289868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  30.14 
 
 
884 aa  53.9  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0938  hypothetical protein  23.83 
 
 
672 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>