38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0685 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0685  hypothetical protein  100 
 
 		 571 aa  1147    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0910  hypothetical protein  64.5 
 
 		 570 aa  744    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2639  hypothetical protein  28.71 
 
 		 573 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0014587  decreased coverage  1.98155e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2826  hypothetical protein  27.52 
 
 		 659 aa  144  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.16509  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0570  hypothetical protein  25.79 
 
 		 621 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407962  normal  0.128274 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1631  hypothetical protein  25 
 
 		 594 aa  131  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000289868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5058  hypothetical protein  27.22 
 
 		 564 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4211  hypothetical protein  28.48 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.755848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  21.13 
 
 		 884 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2741  hypothetical protein  29.76 
 
 		 559 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000033035  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4527  hypothetical protein  30.88 
 
 		 427 aa  83.2  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.833765  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1573  hypothetical protein  28.44 
 
 		 558 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.580118  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1444  hypothetical protein  29.15 
 
 		 583 aa  70.9  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1808  hypothetical protein  30.8 
 
 		 587 aa  68.2  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00269931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0280  hypothetical protein  28.44 
 
 		 602 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2699  Abortive phage infection  27.59 
 
 		 571 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2605  hypothetical protein  26.6 
 
 		 583 aa  64.3  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1231  Abortive phage infection  27.97 
 
 		 567 aa  59.7  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2370  hypothetical protein  28.16 
 
 		 706 aa  59.7  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1573  hypothetical protein  21.81 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1325  hypothetical protein  24.35 
 
 		 564 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0571  hypothetical protein  26.16 
 
 		 661 aa  57.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0009  hypothetical protein  26.64 
 
 		 589 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3657  abortive infection phage resistance protein, putative  28.36 
 
 		 583 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00483557  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2090  hypothetical protein  28.74 
 
 		 600 aa  56.6  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0662343  normal  0.183735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3074  hypothetical protein  26.29 
 
 		 594 aa  55.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0195  hypothetical protein  28.43 
 
 		 589 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.520308  normal  0.0593303 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0767  abortive infection phage resistance protein  23.86 
 
 		 567 aa  54.7  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2265  hypothetical protein  27.74 
 
 		 708 aa  54.7  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0442234  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2679  hypothetical protein  25.71 
 
 		 554 aa  54.3  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000692051  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0934  hypothetical protein  27.61 
 
 		 587 aa  54.3  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0606328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0341  hypothetical protein  30.08 
 
 		 599 aa  52.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0752  Abortive phage infection  27.8 
 
 		 684 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1326  hypothetical protein  28.57 
 
 		 588 aa  48.9  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330951  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23140  hypothetical protein  26.56 
 
 		 549 aa  48.5  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0311  hypothetical protein  21.95 
 
 		 628 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4170  hypothetical protein  27.07 
 
 		 571 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1249  hypothetical protein  24.88 
 
 		 658 aa  44.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0525958  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>