38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4211 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4211  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  661    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.755848  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1631  hypothetical protein  43.26 
 
 
594 aa  263  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000289868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0570  hypothetical protein  38.35 
 
 
621 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407962  normal  0.128274 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5058  hypothetical protein  32.42 
 
 
564 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2639  hypothetical protein  34.8 
 
 
573 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0014587  decreased coverage  1.98155e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2826  hypothetical protein  32.92 
 
 
659 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.16509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  29.9 
 
 
884 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2741  hypothetical protein  34.13 
 
 
559 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000033035  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0685  hypothetical protein  28.48 
 
 
571 aa  105  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0910  hypothetical protein  29.04 
 
 
570 aa  99.8  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1575  hypothetical protein  29.69 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1573  hypothetical protein  30 
 
 
558 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.580118  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4527  hypothetical protein  30.3 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.833765  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1444  hypothetical protein  28.57 
 
 
583 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2699  Abortive phage infection  25.1 
 
 
571 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2090  hypothetical protein  28.95 
 
 
600 aa  66.2  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0662343  normal  0.183735 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1573  hypothetical protein  36.13 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0280  hypothetical protein  31.18 
 
 
602 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2605  hypothetical protein  22.76 
 
 
583 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1231  Abortive phage infection  36.97 
 
 
567 aa  63.9  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2746  hypothetical protein  28.21 
 
 
699 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0009  hypothetical protein  27.81 
 
 
589 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101809  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3074  hypothetical protein  27.98 
 
 
594 aa  59.7  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3657  abortive infection phage resistance protein, putative  29.59 
 
 
583 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00483557  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0767  abortive infection phage resistance protein  25.53 
 
 
567 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1325  hypothetical protein  24.39 
 
 
564 aa  55.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2370  hypothetical protein  31.9 
 
 
706 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0341  hypothetical protein  27.33 
 
 
599 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1249  hypothetical protein  24.77 
 
 
658 aa  53.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0525958  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4170  hypothetical protein  23.27 
 
 
571 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1771  hypothetical protein  27.32 
 
 
591 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0571  hypothetical protein  24.3 
 
 
661 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0934  hypothetical protein  27.54 
 
 
587 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0606328  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0938  hypothetical protein  27.5 
 
 
672 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002157 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1808  hypothetical protein  30.61 
 
 
587 aa  50.1  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00269931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1326  hypothetical protein  26.67 
 
 
588 aa  46.2  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2679  hypothetical protein  27.66 
 
 
554 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000692051  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23140  hypothetical protein  27.86 
 
 
549 aa  43.5  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>