41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2746 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2746  hypothetical protein  100 
 
 		 699 aa  1428    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0009  hypothetical protein  38.16 
 
 		 589 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3074  hypothetical protein  36.2 
 
 		 594 aa  342  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0752  Abortive phage infection  35.67 
 
 		 684 aa  337  5e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0280  hypothetical protein  33.06 
 
 		 602 aa  335  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2090  hypothetical protein  34.97 
 
 		 600 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0662343  normal  0.183735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4269  hypothetical protein  33.85 
 
 		 654 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0571  hypothetical protein  32.77 
 
 		 661 aa  290  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0938  hypothetical protein  28.1 
 
 		 672 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002157 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1249  hypothetical protein  30.26 
 
 		 658 aa  249  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0525958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2370  hypothetical protein  30.26 
 
 		 706 aa  231  5e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0195  hypothetical protein  33.95 
 
 		 589 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.520308  normal  0.0593303 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1326  hypothetical protein  29.7 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2523  hypothetical protein  32.12 
 
 		 572 aa  74.7  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1325  hypothetical protein  30.12 
 
 		 564 aa  70.5  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0767  abortive infection phage resistance protein  27.71 
 
 		 567 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2699  Abortive phage infection  31.46 
 
 		 571 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1771  hypothetical protein  28.07 
 
 		 591 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241962  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5058  hypothetical protein  30.43 
 
 		 564 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1631  hypothetical protein  29.88 
 
 		 594 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000289868  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2605  hypothetical protein  30.19 
 
 		 583 aa  68.6  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0311  hypothetical protein  27.59 
 
 		 628 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2826  hypothetical protein  30.38 
 
 		 659 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.16509  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0341  hypothetical protein  25.83 
 
 		 599 aa  65.1  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2639  hypothetical protein  31.93 
 
 		 573 aa  64.3  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0014587  decreased coverage  1.98155e-17 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4527  hypothetical protein  27.04 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.833765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2265  hypothetical protein  26.22 
 
 		 708 aa  62  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0442234  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4211  hypothetical protein  28.21 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.755848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2679  hypothetical protein  27.96 
 
 		 554 aa  61.6  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000692051  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0934  hypothetical protein  27.84 
 
 		 587 aa  60.8  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0606328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1444  hypothetical protein  30.49 
 
 		 583 aa  60.1  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0570  hypothetical protein  24.74 
 
 		 621 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407962  normal  0.128274 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1573  hypothetical protein  29.52 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.580118  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0910  hypothetical protein  29.07 
 
 		 570 aa  58.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23140  hypothetical protein  30.67 
 
 		 549 aa  55.5  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  29.55 
 
 		 884 aa  54.3  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3657  abortive infection phage resistance protein, putative  24.55 
 
 		 583 aa  53.9  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00483557  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1808  hypothetical protein  31.08 
 
 		 587 aa  48.9  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00269931  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4170  hypothetical protein  27.78 
 
 		 571 aa  47  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1231  Abortive phage infection  27.01 
 
 		 567 aa  45.8  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2741  hypothetical protein  25.26 
 
 		 559 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000033035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>