35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1631 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1631  hypothetical protein  100 
 
 
594 aa  1226    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000289868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0570  hypothetical protein  35.08 
 
 
621 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407962  normal  0.128274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4211  hypothetical protein  43.26 
 
 
323 aa  263  8.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.755848  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5058  hypothetical protein  27.92 
 
 
564 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2826  hypothetical protein  29.31 
 
 
659 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.16509  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2639  hypothetical protein  28.49 
 
 
573 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0014587  decreased coverage  1.98155e-17 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  26.84 
 
 
884 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0685  hypothetical protein  25 
 
 
571 aa  131  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0910  hypothetical protein  25.23 
 
 
570 aa  117  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1573  hypothetical protein  29.19 
 
 
324 aa  107  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2741  hypothetical protein  29.58 
 
 
559 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000033035  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1575  hypothetical protein  29.77 
 
 
246 aa  99.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1573  hypothetical protein  27.47 
 
 
558 aa  80.5  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.580118  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4527  hypothetical protein  31.46 
 
 
427 aa  75.5  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.833765  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2605  hypothetical protein  27.05 
 
 
583 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0938  hypothetical protein  26.6 
 
 
672 aa  70.5  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002157 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2090  hypothetical protein  23.72 
 
 
600 aa  70.5  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0662343  normal  0.183735 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2370  hypothetical protein  28.44 
 
 
706 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2746  hypothetical protein  29.88 
 
 
699 aa  68.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0009  hypothetical protein  29.74 
 
 
589 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101809  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3074  hypothetical protein  30.04 
 
 
594 aa  68.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1231  Abortive phage infection  24.83 
 
 
567 aa  67.8  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0280  hypothetical protein  28.65 
 
 
602 aa  66.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4269  hypothetical protein  29 
 
 
654 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0752  Abortive phage infection  28.25 
 
 
684 aa  60.8  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1444  hypothetical protein  30.13 
 
 
583 aa  60.5  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0571  hypothetical protein  30.77 
 
 
661 aa  57  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1249  hypothetical protein  25.99 
 
 
658 aa  55.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0525958  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1325  hypothetical protein  26.17 
 
 
564 aa  54.3  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2699  Abortive phage infection  23.99 
 
 
571 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0311  hypothetical protein  22.49 
 
 
628 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1808  hypothetical protein  28.57 
 
 
587 aa  45.8  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00269931  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0341  hypothetical protein  27.33 
 
 
599 aa  44.3  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2265  hypothetical protein  27.15 
 
 
708 aa  44.3  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0442234  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2523  hypothetical protein  29.79 
 
 
572 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>