42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2826 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2826  hypothetical protein  100 
 
 
659 aa  1352    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.16509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1631  hypothetical protein  29.31 
 
 
594 aa  206  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000289868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0570  hypothetical protein  26.32 
 
 
621 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407962  normal  0.128274 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5058  hypothetical protein  26.71 
 
 
564 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0685  hypothetical protein  27.52 
 
 
571 aa  144  6e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2639  hypothetical protein  25.33 
 
 
573 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0014587  decreased coverage  1.98155e-17 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4211  hypothetical protein  32.92 
 
 
323 aa  134  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.755848  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0910  hypothetical protein  27.92 
 
 
570 aa  131  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2741  hypothetical protein  26.1 
 
 
559 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000033035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  24.11 
 
 
884 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1573  hypothetical protein  26.75 
 
 
324 aa  91.7  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1573  hypothetical protein  22.83 
 
 
558 aa  80.5  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.580118  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2090  hypothetical protein  26.98 
 
 
600 aa  77.4  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0662343  normal  0.183735 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4527  hypothetical protein  29.36 
 
 
427 aa  73.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.833765  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0009  hypothetical protein  28.25 
 
 
589 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101809  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1325  hypothetical protein  22.85 
 
 
564 aa  72.4  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3074  hypothetical protein  28.77 
 
 
594 aa  72  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0280  hypothetical protein  30.06 
 
 
602 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2605  hypothetical protein  27.15 
 
 
583 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0752  Abortive phage infection  26.14 
 
 
684 aa  67.8  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1575  hypothetical protein  24.32 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1444  hypothetical protein  33.78 
 
 
583 aa  66.6  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2746  hypothetical protein  30.38 
 
 
699 aa  66.6  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0571  hypothetical protein  22.86 
 
 
661 aa  65.1  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2265  hypothetical protein  34.43 
 
 
708 aa  64.3  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0442234  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2679  hypothetical protein  29.29 
 
 
554 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000692051  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0934  hypothetical protein  25.73 
 
 
587 aa  61.2  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0606328  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2370  hypothetical protein  27.89 
 
 
706 aa  60.8  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0938  hypothetical protein  25.21 
 
 
672 aa  58.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2699  Abortive phage infection  23.82 
 
 
571 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1249  hypothetical protein  27.98 
 
 
658 aa  58.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0525958  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0341  hypothetical protein  31.9 
 
 
599 aa  57  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3657  abortive infection phage resistance protein, putative  26.77 
 
 
583 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00483557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4170  hypothetical protein  25.16 
 
 
571 aa  55.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0311  hypothetical protein  25.6 
 
 
628 aa  55.1  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1771  hypothetical protein  24.61 
 
 
591 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241962  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1326  hypothetical protein  29.2 
 
 
588 aa  53.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2523  hypothetical protein  26.28 
 
 
572 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0767  abortive infection phage resistance protein  23.64 
 
 
567 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23140  hypothetical protein  32.89 
 
 
549 aa  47.4  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0195  hypothetical protein  26.09 
 
 
589 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.520308  normal  0.0593303 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1808  hypothetical protein  27.78 
 
 
587 aa  45.4  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00269931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>