36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0009 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0009  hypothetical protein  100 
 
 
589 aa  1217    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101809  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0280  hypothetical protein  56.86 
 
 
602 aa  709    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3074  hypothetical protein  64.27 
 
 
594 aa  818    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2090  hypothetical protein  46.72 
 
 
600 aa  539  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0662343  normal  0.183735 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2746  hypothetical protein  39.5 
 
 
699 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0752  Abortive phage infection  37.85 
 
 
684 aa  362  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0571  hypothetical protein  35.95 
 
 
661 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4269  hypothetical protein  32.92 
 
 
654 aa  274  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1249  hypothetical protein  33.33 
 
 
658 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0525958  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2370  hypothetical protein  31.05 
 
 
706 aa  240  5.999999999999999e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0938  hypothetical protein  28.14 
 
 
672 aa  233  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002157 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1771  hypothetical protein  35.1 
 
 
591 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241962  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0195  hypothetical protein  33.12 
 
 
589 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.520308  normal  0.0593303 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1325  hypothetical protein  30.72 
 
 
564 aa  73.9  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2523  hypothetical protein  29.45 
 
 
572 aa  73.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2826  hypothetical protein  28.25 
 
 
659 aa  73.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.16509  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2605  hypothetical protein  25.76 
 
 
583 aa  70.5  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1444  hypothetical protein  27.98 
 
 
583 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1631  hypothetical protein  29.74 
 
 
594 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000289868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4170  hypothetical protein  28.97 
 
 
571 aa  66.6  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23140  hypothetical protein  31.91 
 
 
549 aa  65.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0767  abortive infection phage resistance protein  26.11 
 
 
567 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4211  hypothetical protein  27.81 
 
 
323 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.755848  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1326  hypothetical protein  27.74 
 
 
588 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2679  hypothetical protein  30.07 
 
 
554 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000692051  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0341  hypothetical protein  25.9 
 
 
599 aa  56.6  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2699  Abortive phage infection  33.68 
 
 
571 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1808  hypothetical protein  29.11 
 
 
587 aa  55.5  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00269931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0934  hypothetical protein  25.83 
 
 
587 aa  55.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0606328  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0685  hypothetical protein  26.64 
 
 
571 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0311  hypothetical protein  27.39 
 
 
628 aa  53.9  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3657  abortive infection phage resistance protein, putative  25.17 
 
 
583 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00483557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1573  hypothetical protein  25.53 
 
 
558 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.580118  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2639  hypothetical protein  23.58 
 
 
573 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0014587  decreased coverage  1.98155e-17 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4527  hypothetical protein  29.2 
 
 
427 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.833765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2265  hypothetical protein  24.29 
 
 
708 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0442234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>