11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1573 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1573  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  663    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1631  hypothetical protein  29.19 
 
 		 594 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000289868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5058  hypothetical protein  28.21 
 
 		 564 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2826  hypothetical protein  26.75 
 
 		 659 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.16509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 884 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0570  hypothetical protein  25.99 
 
 		 621 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407962  normal  0.128274 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2639  hypothetical protein  25.8 
 
 		 573 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0014587  decreased coverage  1.98155e-17 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4211  hypothetical protein  36.13 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.755848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0685  hypothetical protein  21.81 
 
 		 571 aa  59.3  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2741  hypothetical protein  24.51 
 
 		 559 aa  49.7  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000033035  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0910  hypothetical protein  21.24 
 
 		 570 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>