23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0404 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0404  amidohydrolase 2  100 
 
 		 415 aa  839    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.826909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0537  amidohydrolase 2  40.28 
 
 		 414 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0087  amidohydrolase 2  36.43 
 
 		 334 aa  140  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655536  hitchhiker  0.0000125986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2775  hypothetical protein  34.58 
 
 		 330 aa  136  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.03615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3364  amidohydrolase 2  34.51 
 
 		 339 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  33.23 
 
 		 334 aa  133  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0286  amidohydrolase 2  32.59 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1101  amidohydrolase 2  30.95 
 
 		 329 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3030  hypothetical protein  33.93 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.911136  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0887  putative mannonate dehydratase  28 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  24.34 
 
 		 288 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  26.96 
 
 		 311 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  29.29 
 
 		 297 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  20.74 
 
 		 285 aa  50.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  26.43 
 
 		 295 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 884 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  27.66 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  25.37 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  25.37 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  25.37 
 
 		 341 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  26.15 
 
 		 287 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  25.13 
 
 		 308 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 291 aa  43.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>