24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3030 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3030  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.911136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0087  amidohydrolase 2  76 
 
 		 334 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655536  hitchhiker  0.0000125986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2775  hypothetical protein  65.11 
 
 		 330 aa  431  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.03615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0286  amidohydrolase 2  62.15 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  61.83 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3364  amidohydrolase 2  60.37 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1101  amidohydrolase 2  59.63 
 
 		 329 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0537  amidohydrolase 2  31.85 
 
 		 414 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0404  amidohydrolase 2  34.15 
 
 		 415 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.826909 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0887  putative mannonate dehydratase  27.8 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.97 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  25.19 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  27.94 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  28.83 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  23.21 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  32.71 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  28.83 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  25.4 
 
 		 269 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  28.8 
 
 		 280 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  50 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  25.69 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  24.02 
 
 		 288 aa  43.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>