15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0537 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0537  amidohydrolase 2  100 
 
 
414 aa  852    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0404  amidohydrolase 2  40.28 
 
 
415 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.826909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  35.42 
 
 
334 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0286  amidohydrolase 2  35.42 
 
 
330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1101  amidohydrolase 2  31.25 
 
 
329 aa  143  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3364  amidohydrolase 2  35.25 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0087  amidohydrolase 2  32.74 
 
 
334 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655536  hitchhiker  0.0000125986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2775  hypothetical protein  31.82 
 
 
330 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.03615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3030  hypothetical protein  31.85 
 
 
325 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.911136  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0887  putative mannonate dehydratase  25.21 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
286 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  30.48 
 
 
289 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  29.52 
 
 
293 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  30.67 
 
 
279 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  30.86 
 
 
289 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>