82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2888 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  100 
 
 		 255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  25.19 
 
 		 288 aa  92  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 324 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  25.19 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  26.69 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  29.69 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  29.65 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  30.43 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  24.9 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  31.02 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.78 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  26.27 
 
 		 286 aa  62  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  31.9 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  27.81 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  27.06 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  29.52 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  22.5 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.46 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  27.47 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  26.34 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  27.7 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  29.95 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  27.11 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  29.17 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  24.28 
 
 		 276 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  25.99 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6909  amidohydrolase 2  28.05 
 
 		 266 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  26.94 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  25 
 
 		 246 aa  52  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  29.46 
 
 		 392 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  22.62 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  23.32 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  23.02 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  27.07 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  28.51 
 
 		 341 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  28.51 
 
 		 385 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  27.98 
 
 		 280 aa  49.3  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  22.5 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  27.03 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  26.63 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 303 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  28.1 
 
 		 341 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  25.37 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  27.42 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  28.1 
 
 		 341 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  26.62 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  26.43 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  29.79 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  22.71 
 
 		 339 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  23.48 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  21.9 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2062  amidohydrolase 2  31.93 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  27.57 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  26.11 
 
 		 300 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  26.56 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  32.77 
 
 		 884 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  26.24 
 
 		 293 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  24.82 
 
 		 278 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  24.15 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  26.37 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  22.45 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  27.62 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  25.38 
 
 		 298 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  25.38 
 
 		 298 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  23.69 
 
 		 326 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.63 
 
 		 339 aa  42  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  25.42 
 
 		 364 aa  42.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  25.38 
 
 		 298 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>