94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1238 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  100 
 
 		 296 aa  592  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  56.79 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  59.03 
 
 		 884 aa  329  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  59.45 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  56.8 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  57.88 
 
 		 308 aa  318  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  55.9 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  58.28 
 
 		 297 aa  314  9e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  57.48 
 
 		 297 aa  313  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  58.87 
 
 		 285 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  53.9 
 
 		 311 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  52.23 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  53.4 
 
 		 301 aa  296  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  55.67 
 
 		 289 aa  295  7e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  31.99 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  27.02 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  28.66 
 
 		 341 aa  99  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  28.34 
 
 		 341 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  28.34 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  28.34 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  32.98 
 
 		 268 aa  86.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  21.84 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  25.88 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  29.61 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  29.44 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  23.39 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  32.37 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  28.09 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  23.47 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  28.65 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  27.68 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  29.05 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  23.93 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  28.22 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  26.01 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  29.02 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  21.51 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  25.34 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  28.34 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  23.79 
 
 		 291 aa  53.1  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 287 aa  52.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  21.48 
 
 		 269 aa  52.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  27.12 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  26.89 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  27.72 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  25.14 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  25.14 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  27.72 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  28.1 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  24.32 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  25.14 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  24.85 
 
 		 218 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 298 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  28.08 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  27.17 
 
 		 282 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 300 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  23.6 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  26.9 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  25.22 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  26.59 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  26.33 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  25.94 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  31.68 
 
 		 392 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  23.49 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 277 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  23.76 
 
 		 290 aa  46.6  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  26 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 287 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  22.42 
 
 		 262 aa  46.2  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  27.96 
 
 		 303 aa  45.8  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  26.74 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  24.37 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  23.98 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  25.53 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  24.64 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  23.58 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  26.84 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  26.35 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  25.5 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  25.23 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  25 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.57 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  26.88 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  23.38 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2276  amidohydrolase 2  32.43 
 
 		 260 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523292  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  24.63 
 
 		 354 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  24.57 
 
 		 265 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  31.65 
 
 		 279 aa  42.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>