110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3385 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  100 
 
 		 276 aa  558  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  45.85 
 
 		 280 aa  229  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  41.45 
 
 		 273 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  40.51 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  42.06 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  39.22 
 
 		 262 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  34.03 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  31.33 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  31.7 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  34.16 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.42 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  25.7 
 
 		 288 aa  89.4  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  29.74 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  28.34 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  32.45 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  28.29 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  27.78 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  22.92 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  30.19 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  30.89 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  30.35 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  28.17 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  26.81 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  27.43 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  26.21 
 
 		 280 aa  62  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  26.45 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  26.45 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  30.92 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  25.36 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  30.43 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  26.09 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  27.5 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  26.14 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  28.44 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  28.9 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  26.13 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  25.21 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  29.44 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  28.37 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  29.1 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  30.95 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  28.17 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  28 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  24.62 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  27.31 
 
 		 297 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  24.58 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  30.27 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  26.52 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  28.24 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  30.87 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  31.17 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  29.73 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  27.84 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  26.2 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  28.66 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  29.31 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  25.29 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  29.31 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  25 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  28.09 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  27.49 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  29.22 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  25.89 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  29.73 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  29.31 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  28.72 
 
 		 358 aa  50.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  29.93 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  29.53 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 301 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2218  amidohydrolase 2  28.5 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.0155453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  31.55 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  28.24 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  25.6 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  29.79 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  27.21 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  29.6 
 
 		 303 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  24.9 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  25.43 
 
 		 332 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  30.61 
 
 		 392 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  25.7 
 
 		 338 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  22.18 
 
 		 288 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  28.19 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  23.58 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2889  hypothetical protein  28.74 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0597635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  23.89 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  25.78 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 372 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  25 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  25.51 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  24.3 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>