90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2036 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  100 
 
 		 218 aa  454  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  32.34 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  28.4 
 
 		 282 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  25.11 
 
 		 291 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  27.23 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  28.4 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  26.84 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  25.82 
 
 		 392 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  26.82 
 
 		 308 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  24.02 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  25.85 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  26.17 
 
 		 293 aa  58.2  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  24.58 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  24.89 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  23.85 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  27.05 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  27.11 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  21.18 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2369  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  19.81 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  21.81 
 
 		 298 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  22.48 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  25.6 
 
 		 289 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  23.72 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  23.44 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  28.24 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  21.28 
 
 		 298 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  23.59 
 
 		 297 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  24.24 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  21.28 
 
 		 298 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  24.7 
 
 		 269 aa  53.1  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.43 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  24.34 
 
 		 311 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  22.51 
 
 		 289 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  25.93 
 
 		 294 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  23.86 
 
 		 283 aa  52.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 358 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  23.71 
 
 		 286 aa  52.4  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  22.84 
 
 		 279 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  22.27 
 
 		 294 aa  52  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  23.73 
 
 		 286 aa  52  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  27.91 
 
 		 294 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  26.22 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2218  amidohydrolase 2  22.87 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.0155453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  25.88 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  24.85 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  24.66 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  23.39 
 
 		 299 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  23.03 
 
 		 297 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  24.86 
 
 		 333 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  19.56 
 
 		 300 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  23.85 
 
 		 289 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  22.6 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  24.18 
 
 		 262 aa  49.3  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  22.17 
 
 		 271 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  24.2 
 
 		 289 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  25.3 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  23.88 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  20.97 
 
 		 300 aa  47.8  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1129  amidohydrolase 2  23.31 
 
 		 326 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.268547 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  20.61 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  21.93 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  25.68 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0925  putative transducer (chemotactic transducer pcta)  24.88 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00204533  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  24.89 
 
 		 294 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  21.71 
 
 		 297 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  26.63 
 
 		 280 aa  45.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  24.78 
 
 		 280 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  27.18 
 
 		 273 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  22.41 
 
 		 294 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  24.42 
 
 		 309 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.35 
 
 		 289 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  21.15 
 
 		 287 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  22.56 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  24.02 
 
 		 301 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  29.81 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  21.36 
 
 		 281 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  21.93 
 
 		 308 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  20.55 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0780  amidohydrolase 2  26.86 
 
 		 276 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  22.1 
 
 		 279 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  22.39 
 
 		 285 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  25.14 
 
 		 297 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  21.37 
 
 		 290 aa  42.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2903  amidohydrolase 2  25.75 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.844973  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0991  TatD-related deoxyribonuclease  25 
 
 		 380 aa  42  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  23.4 
 
 		 338 aa  41.6  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  22.16 
 
 		 305 aa  41.6  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>