110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0143 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  100 
 
 		 280 aa  577  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  47.31 
 
 		 280 aa  268  5.9999999999999995e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  37.96 
 
 		 283 aa  192  8e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  35.23 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  34.41 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  38.21 
 
 		 387 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  36.56 
 
 		 381 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  26.76 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  27.31 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4067  amidohydrolase 2  27.81 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.186813  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  25 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  28.44 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  23.51 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.15 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  25.8 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  26.38 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  26.52 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  24.02 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  27 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  28.67 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.71 
 
 		 629 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  25 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  29.19 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  20.81 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  27.04 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  23.72 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  23.38 
 
 		 358 aa  53.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  22.46 
 
 		 356 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  26.13 
 
 		 317 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  30 
 
 		 338 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.15 
 
 		 342 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  25.77 
 
 		 324 aa  52.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  28.98 
 
 		 262 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  23.67 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  25.97 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  23.68 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  29.1 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  26.27 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  25.76 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  25.29 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  26.5 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  25 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.04 
 
 		 341 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  24.42 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  24.2 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.59 
 
 		 339 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  24.54 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  24.66 
 
 		 319 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  25.11 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  23.28 
 
 		 336 aa  49.3  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  23.36 
 
 		 334 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  22.4 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  22.4 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.55 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.89 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  27.01 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  28.69 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  22.15 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  23.88 
 
 		 341 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  27.68 
 
 		 286 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  23.31 
 
 		 361 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  23.88 
 
 		 385 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  23.88 
 
 		 341 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  25 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  23.51 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0925  putative transducer (chemotactic transducer pcta)  25.7 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00204533  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  22.51 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  26.07 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  29.36 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  26.5 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.25 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  22.57 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  24.34 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  22.48 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  24.58 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  23.89 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  22.27 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  22.36 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  26.54 
 
 		 312 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  26.71 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  26.71 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  26.71 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  23.87 
 
 		 323 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>