30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2218 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2218  amidohydrolase 2  100 
 
 		 304 aa  631  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.0155453 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  25 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  26.52 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  21.84 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  25.9 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  25.9 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  25.9 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  25.9 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  25.51 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.64 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  26.8 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  23.81 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  21.72 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  23.37 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  22.87 
 
 		 218 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  24.27 
 
 		 333 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  28.5 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  23.45 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  23.42 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  23.08 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  22.65 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  29.25 
 
 		 262 aa  46.2  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  21.8 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  28.35 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  25.22 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  25.13 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  21.83 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26.61 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  22.36 
 
 		 287 aa  42.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>