20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4176 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3747  amidohydrolase 2  91.02 
 
 		 334 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4176  amidohydrolase 2  100 
 
 		 335 aa  695    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1692  amidohydrolase 2  97.31 
 
 		 340 aa  681    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3499  amidohydrolase 2  89.22 
 
 		 337 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1629  amidohydrolase 2  77.51 
 
 		 351 aa  551  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3669  hypothetical protein  75.53 
 
 		 344 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43740  hypothetical protein  74.62 
 
 		 344 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2482  amidohydrolase 2  72.67 
 
 		 336 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235621  normal  0.340948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3843  amidohydrolase 2  30.91 
 
 		 390 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3327  amidohydrolase 2  31.45 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2755  amidohydrolase 2  30.81 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.176461  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5795  amidohydrolase 2  34.68 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4097  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0950  amidohydrolase 2  24.76 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0320678 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1464  hypothetical protein  29.82 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0242  amidohydrolase 2  30.89 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1240  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1786  amidohydrolase 2  22.58 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01860  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.86 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1129  amidohydrolase 2  27.47 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.268547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>