13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1464 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1464  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  815    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3327  amidohydrolase 2  54.99 
 
 		 365 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4176  amidohydrolase 2  29.82 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2482  amidohydrolase 2  28.66 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235621  normal  0.340948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1692  amidohydrolase 2  29.82 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3499  amidohydrolase 2  27.53 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3843  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1629  amidohydrolase 2  27.16 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3747  amidohydrolase 2  27.53 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3669  hypothetical protein  27.39 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43740  hypothetical protein  27.39 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4097  amidohydrolase 2  26.71 
 
 		 370 aa  43.5  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0950  amidohydrolase 2  26.12 
 
 		 289 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0320678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>