16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1405 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1405  amidohydrolase 2  100 
 
 
355 aa  710    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  30.88 
 
 
392 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  25.54 
 
 
282 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  24.67 
 
 
283 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  24.71 
 
 
338 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  28.38 
 
 
286 aa  49.3  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  23.73 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  22.13 
 
 
275 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0014  amidohydrolase 2  21.8 
 
 
374 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00386007  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  25.64 
 
 
252 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  24.49 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  22.27 
 
 
283 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3071  amidohydrolase 2  27.85 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  30.05 
 
 
300 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0314  amidohydrolase 2  24.03 
 
 
369 aa  43.5  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349816  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01860  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.54 
 
 
363 aa  43.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>