92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0984 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  100 
 
 		 268 aa  556  1e-157  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  32.29 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  42.57 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  37.44 
 
 		 286 aa  122  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  33.78 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  35.75 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  34.24 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  35.71 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  35.71 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  33.89 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  33.16 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  34.44 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  29.18 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  27.9 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  31.35 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  27.67 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  30.29 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  32.58 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  28.37 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  33.57 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  31.79 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  29.71 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  30.81 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  21.88 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  31.22 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  31.25 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  24.41 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  28.34 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  28.35 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  28 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  30.91 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  33.33 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  26.98 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  25.64 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1316  hypothetical protein  34.23 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  30.87 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  32.21 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  32.16 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  30.12 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  25.27 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  26.07 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  26.55 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  29.79 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0286  amidohydrolase 2  28.31 
 
 		 330 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  23.65 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  30.5 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3364  amidohydrolase 2  28.83 
 
 		 339 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  29.27 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  27.75 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.61 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  28.3 
 
 		 392 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  32.1 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  29.53 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  28.21 
 
 		 286 aa  49.3  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.82 
 
 		 289 aa  48.9  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  30.23 
 
 		 276 aa  48.9  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  27.71 
 
 		 332 aa  48.9  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  27.87 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  31.48 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  31.48 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.2 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  29.63 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 262 aa  46.2  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  27.66 
 
 		 218 aa  46.2  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  29.63 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  25.66 
 
 		 283 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  30.56 
 
 		 277 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2151  amidohydrolase 2  28.68 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  24.12 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  27.05 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  26.35 
 
 		 884 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2105  conserved hypothetical protein  25.26 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  30.26 
 
 		 312 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  28.36 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 288 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0087  amidohydrolase 2  28.22 
 
 		 334 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655536  hitchhiker  0.0000125986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  26.72 
 
 		 311 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0404  amidohydrolase 2  23.16 
 
 		 415 aa  42.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.826909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  25.3 
 
 		 300 aa  42  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 255 aa  42  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 287 aa  42  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>