83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0338 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  91.47 
 
 		 342 aa  667    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  100 
 
 		 342 aa  719    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  88.89 
 
 		 342 aa  651    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  86.84 
 
 		 341 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  85.88 
 
 		 342 aa  627  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  85.09 
 
 		 342 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4449  amidohydrolase 2  83.87 
 
 		 342 aa  622  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  83.53 
 
 		 345 aa  617  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  83.92 
 
 		 342 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  83.63 
 
 		 342 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  82.4 
 
 		 342 aa  616  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  81.87 
 
 		 341 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  81.29 
 
 		 341 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  79.53 
 
 		 341 aa  597  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  78.59 
 
 		 342 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  76.61 
 
 		 341 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  71.64 
 
 		 341 aa  530  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  68.62 
 
 		 342 aa  518  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  65.28 
 
 		 349 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  64.39 
 
 		 349 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  63.74 
 
 		 343 aa  464  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  64.52 
 
 		 340 aa  462  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  63.93 
 
 		 341 aa  462  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  61.36 
 
 		 395 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  61.95 
 
 		 339 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  61.9 
 
 		 335 aa  448  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  54.49 
 
 		 353 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  38.99 
 
 		 334 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  35.67 
 
 		 336 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  34.83 
 
 		 337 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  34.51 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  26 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  25.41 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  23.25 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  28 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  25 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  25.24 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  23.98 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  30.1 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  24.59 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  26.32 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  23.14 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  22.55 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  24 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  23.81 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  22.08 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  21.43 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  23.11 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.63 
 
 		 391 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.56 
 
 		 339 aa  52.8  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.12 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  22.88 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  26.62 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  24.26 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.97 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  22.47 
 
 		 317 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  21.81 
 
 		 358 aa  50.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  23.24 
 
 		 395 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  25.26 
 
 		 307 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  21.82 
 
 		 365 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  24.25 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  24.31 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  27.07 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 368 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  26.18 
 
 		 432 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  26.18 
 
 		 432 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  26.18 
 
 		 432 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  21.5 
 
 		 372 aa  46.2  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.83 
 
 		 282 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  23.48 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  26.55 
 
 		 277 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  19.82 
 
 		 326 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  24.81 
 
 		 390 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  21.91 
 
 		 391 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 444 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 312 aa  42.7  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  20.08 
 
 		 338 aa  42.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  21.09 
 
 		 356 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>