92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5743 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  100 
 
 		 342 aa  714    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  85.04 
 
 		 341 aa  627  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  83.28 
 
 		 342 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  81.52 
 
 		 342 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  81.87 
 
 		 342 aa  616  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  82.4 
 
 		 342 aa  616  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  82.7 
 
 		 342 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  83.63 
 
 		 342 aa  612  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  84.75 
 
 		 342 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  80.94 
 
 		 342 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4449  amidohydrolase 2  82.75 
 
 		 342 aa  608  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  82.7 
 
 		 341 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  81.82 
 
 		 341 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  80.06 
 
 		 341 aa  590  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  79.47 
 
 		 341 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  78.36 
 
 		 345 aa  580  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  72.73 
 
 		 341 aa  521  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  69.88 
 
 		 342 aa  521  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  66.47 
 
 		 349 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  66.77 
 
 		 349 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  66.96 
 
 		 340 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  64.04 
 
 		 339 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  62.87 
 
 		 395 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  63.45 
 
 		 341 aa  459  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  62.46 
 
 		 343 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  61.08 
 
 		 335 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  54.07 
 
 		 353 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  37.28 
 
 		 334 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  36.26 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  33.63 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  26.2 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  24.72 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  26.38 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  25 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  26.85 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  27.87 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  24.11 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  28.93 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  26.72 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  25.31 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.33 
 
 		 350 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  23.31 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  23.85 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  27.98 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  21.43 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  23.32 
 
 		 364 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 336 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  23.42 
 
 		 364 aa  53.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  26.45 
 
 		 278 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.24 
 
 		 391 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  26.78 
 
 		 283 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  22.19 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  21.72 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  22 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  22.19 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  26.72 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  23.05 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  22 
 
 		 358 aa  49.7  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  25 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  25.32 
 
 		 381 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  30 
 
 		 307 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  31.48 
 
 		 279 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  21.15 
 
 		 356 aa  46.2  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  27.91 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  25.31 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  19.54 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  25 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  20.81 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  23 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  25.67 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  22.33 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 277 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  24.6 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  21.92 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  24.59 
 
 		 432 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  24.59 
 
 		 432 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  24.59 
 
 		 432 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  29.57 
 
 		 298 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  29.57 
 
 		 298 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  29.57 
 
 		 298 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  21.16 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  24.36 
 
 		 331 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  22.92 
 
 		 338 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  31.08 
 
 		 270 aa  42.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>