96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5178 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  93.27 
 
 		 342 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  100 
 
 		 342 aa  719    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  88.01 
 
 		 342 aa  643    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  89.47 
 
 		 341 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  94.15 
 
 		 342 aa  686    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  84.46 
 
 		 342 aa  625  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  83.92 
 
 		 342 aa  619  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  80.94 
 
 		 342 aa  609  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4449  amidohydrolase 2  81.52 
 
 		 342 aa  605  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  81.87 
 
 		 341 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  81.58 
 
 		 341 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  80.7 
 
 		 342 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  81.58 
 
 		 341 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  80.65 
 
 		 342 aa  597  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  80.29 
 
 		 345 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  77.71 
 
 		 341 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  73.1 
 
 		 341 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  69.5 
 
 		 342 aa  522  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  62.94 
 
 		 349 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  65.1 
 
 		 340 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  64.81 
 
 		 339 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  62.06 
 
 		 349 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  61.29 
 
 		 395 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  61.29 
 
 		 341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  60.82 
 
 		 343 aa  448  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  62.2 
 
 		 335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  53.49 
 
 		 353 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  38.32 
 
 		 334 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  35.99 
 
 		 337 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  35.09 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  34.51 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  24.35 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  25.96 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  26.05 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  23.88 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  23.71 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  26.1 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  26.24 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  28.57 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  28.44 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  21.75 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  23.7 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  26.98 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  24.51 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  26.14 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  21.25 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.73 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  27.72 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  24.79 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  28.5 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  21.89 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  22.44 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  29.24 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 326 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  23.22 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  22.96 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  21.11 
 
 		 326 aa  53.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  32.43 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  22.95 
 
 		 391 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  22.85 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  25.79 
 
 		 307 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  22.85 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  24.3 
 
 		 276 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  23.32 
 
 		 391 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  24.62 
 
 		 348 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  24.59 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  19.24 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  24.36 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.49 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  25.13 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  21.33 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  27.81 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  26.54 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  19.92 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  24.5 
 
 		 311 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  23.85 
 
 		 277 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  30.86 
 
 		 279 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  22.27 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  31.01 
 
 		 279 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  22.07 
 
 		 361 aa  46.2  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  26.53 
 
 		 381 aa  46.2  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  22.82 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  24.03 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  21.41 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  21.81 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 288 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  22.22 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  21.2 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  21.76 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  25.5 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  23.73 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  24.68 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 316 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  21.13 
 
 		 336 aa  42.7  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>