84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5506 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 363 aa  751    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  38.87 
 
 		 356 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  33.42 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  35.99 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  35.03 
 
 		 316 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  35.31 
 
 		 321 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  34.91 
 
 		 313 aa  166  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  33.8 
 
 		 315 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  31.46 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  30.6 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  27.05 
 
 		 337 aa  122  9e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  28.03 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  23.91 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.25 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  25.84 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  25.76 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.32 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.91 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  24.29 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  28.11 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  24.84 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  22.71 
 
 		 317 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.5 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  23.97 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  24.27 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  26.24 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  26.61 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.51 
 
 		 629 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  24.41 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  26.01 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  24.56 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.94 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  23.49 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  24.73 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.5 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  23.62 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  21.67 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  21.67 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  22.97 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  26.12 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.87 
 
 		 341 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  22.81 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  29.66 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  20.8 
 
 		 351 aa  52.8  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  24.1 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  22.3 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  25.68 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.9 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.55 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  21.89 
 
 		 319 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  23.16 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  23.76 
 
 		 326 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6616  hypothetical protein  34.85 
 
 		 108 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  24.36 
 
 		 342 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  21.71 
 
 		 325 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  25.91 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  24.73 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07440  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  24.52 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.723165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  23.18 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  23.96 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  24.29 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  23.01 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  22.58 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  23.71 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  24.5 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  22.89 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  22.81 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  22.22 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  21.38 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  26.5 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 280 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  22.64 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  23.11 
 
 		 336 aa  43.9  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  22.22 
 
 		 361 aa  43.5  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  37.21 
 
 		 287 aa  43.5  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  22.65 
 
 		 342 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  22.64 
 
 		 335 aa  43.1  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  25 
 
 		 341 aa  42.7  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>